首度基因CEO唐元华:基因测序——生命的说明书


作者丨吕佩

“在未来,每一个人就医或许都要自带一份基因组数据作为自己的生命说明书。”首度生物科技(苏州)有限公司(以下简称:首度基因)CEO唐元华告诉贝壳社记者。

据了解,首度基因是一家专注于基因大数据的生物与IT技术相结合的公司 。公司拥有一支多年从事基因测序、分子生物学、算法开发、与大数据处理的跨学科研发团队,致力打造世界一流的生物信息分析中心,并建立国内权威的基因信息数据库。

数学背景出身的基因人

虽然首度基因是一家专注于做基因测序服务的公司,但是创始人唐元华却是数学背景出身,且求学背景独特。在国内读完数学专业本科和硕士后,唐元华前往美国求学,在美国一边读数学专业博士一边还进行了生命科学的本科学习,此后在康乃尔大学医学院从事博士后研究。唐元华透露,之所以选择读一个生命科学的本科,那是因为被生命科学深深吸引。

在生物医疗领域,人类基因组计划(human genome project, HGP)耳熟能详,它是由美国科学家于1985年率先提出,于1990年正式启动。美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共同参与了这一计划。按照这个计划的设想,要把人体内约2.5万个基因的密码全部解开,同时绘制出人类基因的图谱,这项计划被誉为生命科学的“ 登月计划”,堪比阿波罗登月计划和曼哈顿原子弹计划。正是因此,原本学数学的唐元华,决定转向基因组学的研究。

事实上,华人数量在世界人口中占比很大,但是针对华人基因数据的研究并不多, “我们想专注于打造华人的基因数据库,包括人种的基因和癌症的变异。”唐元华告诉记者。

在学习结束后,唐元华先后进入多家企业从事生物信息相关的工作。曾经在Incyte Genomics,Nuvelo Inc, Beckman Coulter Inc从事基因药物、生物信息、网络科技和信息科技领域的研究和产品开发。2006年,在硅谷创立 Deepdyve Inc,担任总裁兼CTO。Deepdvye公司开发出了两种新的搜索引擎。2013年,唐元华从美国被派到深圳的华大基因工作,负责核心算法团队的管理。数学以及生命科学的学习背景以及生物领域的从业经验为唐元华再次创业奠定了基础。

唐元华与分子生物学专家徐健博士,带领着一批国外留学归来的研发团队于2015年6月创建首度基因,总部位于江苏省苏州市。公司依托强大的海内外科研实力、专利技术和专家人才,以癌症基因检测为起点,引进了世界先进的基因测序平台、肿瘤靶向用药检测平台,并与多家三级甲等医院、第三方医学检验所建立了合作共研关系,提供基因测序、软件数据库等高科技医疗和生物信息服务。此外,首度基因还与美国加州大学、斯坦福大学、中国科技大学等国内外知名研究机构专家建立了合作关系。

基因测序辅助诊断

首度基因通过生物信息学分析提供有助于癌症早期筛查、辅助诊断、用药指导和预后跟踪的有益信息,进而为癌症患者带来强有力的辅助治疗效果,建设了基于高通量基因测序技术和大数据分析平台的整体解决方案。

此外,通过基因检测可以帮助患者做遗传疾病以及先天性疾病的筛查,尤其在孕妇胎儿遗传病或者先天性疾病筛查上应用较多。唐元华表示,首度基因开发了一个技术,可以做到一次性检查,就可以进行全基因序列检测。

目前首度基因产品主要分为两个方向,一个是现代产品,就是现在可以提供的面向客户的健康咨询服务,例如患者为一名自闭症儿童,可以通过基因检测找到变异的基因,然后相应的提供一些相关咨询服务。例如这种缺陷,将会导致什么问题等。这是一种从基因层面辅助诊断的方法。另一方面,首度基因基于自身不断积累的数据库,等到数据库足够大的时候,就可以进行大数据分析,而基因大数据库在未来存在巨大的价值。

据了解,首度基因的产品主要有FD-Exome、FD-180系列、 FD-600系列、FD-Soft-Suite、福满家等。以FD-180系列为例,其检测项目如下:

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FD-Tissue-180使用高通量测序平台、精确测定约 180个重要癌症相关基因的5种变异( 点突变、缺失、插入、拷贝数变化和重排) 。

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传统的癌症分类和诊疗聚焦于疾病的原发位点,例如肺癌,乳腺癌,结肠癌等。但是,基因组的各种改变(点突变、位移、拷贝数增加等)才是导致癌症的真正原因。随着人们对基因变异的深入了解,现在已经可以确定某些变异是导致癌症的驱动变异,并且对于一些驱动变异,已经开发出了有针对性的靶向治疗药品。相比传统的化疗方法,靶向治疗效果更好且产生的毒性较低。这些治疗方法跟癌症的原发位点关系不大却与驱动变异密切相关,只要确定了变异的信息,就可以确定治疗的方案。而首度基因的目标是对于所有癌症,无论其原发位点在什么位置,通过基因测序确定其致癌的变异,达到分子层面的病理诊断,进而推荐有效的靶向药品。

基因测序造福人类

首度基因目前主要以基因测序为主,结合用户和市场需求而研发的产品。唐元华希望将基因测序信息,转化为人类追求健康和战胜疾病的福音。

此外,首度基因致力于打造国内权威的癌症基因信息数据库——中国癌症云平台这一公益数据平台,为广大癌症基因组学研究者们提供免费的数据库资源,共同推进癌症基因领域分析研究的发展,不断完善有助于患者治疗的癌症基因大数据。

在唐元华看来,未来基因测序将会普及。一方面来自于人们对自身生命信息的探索欲望,知道自己是怎么来的。而基因就像计算机里面的原始代码一般,经过一定的编程就成为了生命个体;另一方面,在医疗层面,可能会出现病人就医需要自带一份全基因序列的数据,就像一个人的生命说明书。

据了解,公司此前获得了1000万美元的A轮融资,目前在启动新的融资,唐元华表示希望一些可以在技术上提供支持和自带资源的资本方加入进来。

如果感兴趣请联系本文作者

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